【安捷倫】生物樣本庫：做好樣本質(zhì)控很關(guān)鍵

　　作為轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究的重要疾病資源，生物樣本庫的規(guī)范建設(shè)、科學(xué)管理和可持續(xù)發(fā)展日益受到重視。對于樣本庫的管理而言，其樣本的質(zhì)控需貫穿在樣本的整個生命過程中。

　　源頭的質(zhì)控有助于對采集到的樣本進(jìn)行分級，不同類型的疾病樣本如血液、組織、體液等根據(jù)其生物學(xué)特性得到了正確的處理和保存，從而避免入庫樣本的質(zhì)量偏倚和資源浪費(fèi)。

　　過程的質(zhì)控有助于評估生物樣本庫的保存條件是否得當(dāng)，尤其是更換實(shí)驗(yàn)流程和儲存系統(tǒng)時，更需要定期進(jìn)行回顧性分析，確保樣本可以得到很好的長期保存。

　　成果的反饋管理對于進(jìn)入產(chǎn)出階段的樣本庫至關(guān)重要，有助于樣本庫總結(jié)經(jīng)驗(yàn)和教訓(xùn)，利用成果爭取更多樣本庫建設(shè)資源，形成“高質(zhì)量樣本庫 一 支撐轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究 一 更高質(zhì)量的樣本庫”的正反饋，以保證樣本庫的可持續(xù)發(fā)展。

　　Heidelberg CardioBiobank (HCB) 是德國大的生物樣本庫之一，主要關(guān)注心血管疾病。同時也作為多個國家和國際臨床試驗(yàn)和研究項(xiàng)目的核心生物樣本庫。2014 年，HCB 對樣本庫系統(tǒng)進(jìn)行了重組和改進(jìn)，建立了一個大型的、全自動的 -80 ℃ 存儲系統(tǒng)，容量高達(dá) 120 萬個樣品，并引進(jìn)了安捷倫 TapeStation 4150，在樣本采集和管理過程中進(jìn)行質(zhì)控，以確保能夠儲存合適的樣本以及選擇適合的儲存條件，進(jìn)一步保證了利用樣本開展轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究結(jié)果的可靠性與科學(xué)性。

　　HCB 樣本處理流程

　　在 HCB 的一項(xiàng)回顧性分析中，詳細(xì)闡述了安捷倫 TapeStation 4150 在生物樣本庫的管控系統(tǒng)中發(fā)揮的重要作用。

　　實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)：

　　● 對 -80℃ 保存了 9 年且無反復(fù)凍融的 DNA 樣本質(zhì)量進(jìn)行分析。從 2010 到 2018，對每年的入庫樣本隨機(jī)抽取 20 例。

　　● 2014 年前是手工柱膜法提取，2015 年后自動化提取。借此結(jié)果評估提取方法的影響。

　　結(jié)果和結(jié)論：

　　● 9 年間樣品質(zhì)量的比較。使用安捷倫 TapeStation 4150 對每年的 20 份 DNA 樣本進(jìn)行分析。2014 年，由于提取方法的改變，對兩組進(jìn)行了分析。

　　● 選取 2010 年至 2018 年的代表性樣本進(jìn)行比較。樣品完整性在 2015 年后有所提高，表現(xiàn)為較高的 DIN 值。

　　● 用 Quantus 熒光儀和安捷倫 4150 自動化電泳系統(tǒng)測定每年代表性樣本的 DNA 濃度。2014 - 2015 年 DNA 濃度的增加是手工提取轉(zhuǎn)向自動化提取的結(jié)果。

　　由于 2015 年流程的重大改進(jìn)，HCB 對樣本收集、運(yùn)輸和制備等工作流程進(jìn)行了評估。通過自動化 DNA 提取過程，可以顯著提高 DNA 的質(zhì)量和濃度。使用安捷倫自動化電泳系統(tǒng)進(jìn)行分析，可以很好地給出 DNA 的質(zhì)量和濃度結(jié)果，提供樣本處理和保存流程是否得當(dāng)?shù)馁|(zhì)控依據(jù)。

　　如今，個性化醫(yī)療的需求非常明顯，“garbage in equals garbage out”，我們需要使用上佳樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)化研究。安捷倫自動化電泳系統(tǒng)可以順利集成到生物樣本庫的工作流程中，作為可靠的質(zhì)控工具，驗(yàn)證對下游應(yīng)用很重要的核酸樣本的質(zhì)量。

　　廣為生物樣本庫喜愛的安捷倫質(zhì)控產(chǎn)品究竟長什么樣呢?

　　在高顏值的加持下，安捷倫質(zhì)控天團(tuán)的性能也非常能打：

　　安捷倫 2100 生物分析儀系統(tǒng)

　　利用芯片實(shí)驗(yàn)室電泳技術(shù)分離 DNA、RNA 和蛋白質(zhì)樣品，適用于任何質(zhì)控工作流程。

　　安捷倫 TapeStation 系統(tǒng)

　　易于使用的解決方案，能夠快速、準(zhǔn)確地評估 DNA 和 RNA 樣品，每個樣品只需 1–2 分鐘。

　　● 4150 TapeStation 系統(tǒng)：一次能夠分析 16 個樣品，適合低通量實(shí)驗(yàn)室

　　● 4200 TapeStation 系統(tǒng)：一次可運(yùn)行多達(dá) 96 個樣品，適合高通量工作流程

　　安捷倫片段分析儀系統(tǒng)

　　用于核酸分析的平行毛細(xì)管電泳儀，適合各種應(yīng)用和通量。

　　● 5200 片段分析儀系統(tǒng)：采用 12 毛細(xì)管陣列，可運(yùn)行低通量、中等通量的工作流程

　　● 5300 片段分析儀系統(tǒng)：可選擇 48 毛細(xì)管陣列或 96 毛細(xì)管陣列，適合高通量、超高通量的工作流程

　　● 5400 片段分析儀系統(tǒng)：自動化集成的 96 毛細(xì)管陣列，可實(shí)現(xiàn)超高通量工作流程

　　安捷倫 Femto Pulse 系統(tǒng)

　　市面上一款自動化脈沖場電泳儀，在 1.5h 內(nèi)即可完成大片段基因 DNA 分析，并實(shí)現(xiàn)超高靈敏度 DNA 和 RNA 檢測。

　　專家評價

　　TapeStation 系統(tǒng)使生物樣本庫中的 DNA 和 RNA 質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)化成為可能。其簡單的設(shè)置、操作和數(shù)據(jù)分析工具對我們的應(yīng)用而言是理想選擇。TapeStation 工作流程將作為一項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)量測量納入美國病理學(xué)家協(xié)會 (CAP) 認(rèn)證。

　　—— Sharmeela Kaushal

　　UCSD Moores 癌癥中心，

　　生物樣本庫與組織技術(shù)共享資源

　　“

　　運(yùn)行過 PFGE 的任何人員都將領(lǐng)會到 Femto Pulse 在分析高分子量 DNA 時的易用性和速度。它已成為 A 公司和 B 公司長讀長平臺進(jìn)行樣品前處理的關(guān)鍵工具，可確保這些儀器的高質(zhì)量/高產(chǎn)率。而且，隨著技術(shù)邊界向越來越低樣品起始量的擴(kuò)展，尤其是對 RNA/單細(xì)胞技術(shù)而言，F(xiàn)emto Pulse 出色的靈敏度使我們能夠在前所未有的低濃度下評估樣品質(zhì)量。

　　”

　　—— Peter Schweitzer

　　康奈爾大學(xué)基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人

（責(zé)任編輯：華康）